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Baptiste Marthy, PhD

Baptiste Marthy soutiendra sa thèse intitulée “Quantification du trafic axonal par microscopie de front d’onde à haute résolution” le lundi 23 novembre 2026 à 14h15 en salle Pierre Cotton de l’Institut Fresnel.

La présentation se fera en français et les slides seront anglais. Un lien Zoom sera disponible pour les personnes préférant suivre la soutenance à distance.

 

Composition du jury : 
– Christophe LETERRIER , Président du Jury
– Pierre MARQUET, Rapporteur
– François TREUSSART, Rapporteur 
– Lydia DANGLOT, Examinatrice
– Pierre BON, Examinateur
– Guillaume BAFFOU, Directeur de thèse
– Maxime CAZORLA, Co-directeur de thèse

 

Résumé : Les vésicules assurent le transport de molécules le long de l’axone. Elles sont petites (de 50 à 1000~nanomètres de diamètre) et rapides (jusqu’à quelques micromètres par seconde). Il existe une multitude de populations de vésicules, chacune associée à une fonction donnée. Une population est habituellement imagée par microscopie de fluorescence, qui signale la présence d’une molécule spécifique de cette population, appelée marqueur. Ce contraste ne révèle que la population choisie et est aveugle à toutes les autres. Cette thèse explore l’utilisation d’une technique d’imagerie quantitative de phase pour décrire le transport axonal. Le contraste obtenu repose sur la déformation du front d’onde par l’échantillon. Cette déformation est proportionnelle à la concentration locale de biomolécules, c’est-à-dire à la densité de masse sèche. Mesurer la masse sèche d’une vésicule revient à mesurer la quantité de matière qu’elle transporte, une information difficilement accessible en microscopie de fluorescence. Des neurones corticaux de rat ont été cultivés dans des puces microfluidiques. Les axones s’y développent dans des microcanaux, ce qui permet de les isoler des corps cellulaires et des dendrites. Le trafic axonal est étudié à l’aide d’un microscope bimodal : un signal de fluorescence renseigne sur l’identité de la vésicule, tandis que la mesure du front d’onde donne accès à sa masse. Le signal de front d’onde généré par une vésicule étant faiblement contrasté, une procédure complète d’analyse d’image a été développée pour mesurer la masse sèche des vésicules en mouvement dans les axones. Couplée à l’imagerie de fluorescence, l’imagerie quantitative de phase renseigne sur la distribution de masse au sein d’une population identifiée. Utilisée seule, elle permet de quantifier le transport axonal sans marquage et à grande échelle. Cette thèse développe les outils nécessaires et démontre que la masse est une information pertinente pour analyser le trafic des vésicules axonales.

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